Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms