Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SCO2O43819 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCO2O43819 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCO2O43819 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCO2O43819 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCO2O43819 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCO2O43819 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCO2O43819 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCO2O43819 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCO2O43819 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCO2O43819 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCO2O43819 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCO2O43819 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCO2O43819 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCO2O43819 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCO2O43819 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCO2O43819 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCO2O43819 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCO2O43819 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SCO2O43819 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCO2O43819 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCO2O43819 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCO2O43819 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SCO2O43819 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SCO2O43819 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCO2O43819 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCO2O43819 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCO2O43819 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCO2O43819 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCO2O43819 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SCO2O43819 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCO2O43819 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SCO2O43819 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCO2O43819 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SCO2O43819 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCO2O43819 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCO2O43819 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCO2O43819 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SCO2O43819 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCO2O43819 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCO2O43819 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCO2O43819 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SCO2O43819 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SCO2O43819 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SCO2O43819 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCO2O43819 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCO2O43819 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCO2O43819 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCO2O43819 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCO2O43819 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCO2O43819 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCO2O43819 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SCO2O43819 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SCO2O43819 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCO2O43819 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCO2O43819 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCO2O43819 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCO2O43819 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCO2O43819 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCO2O43819 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCO2O43819 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCO2O43819 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCO2O43819 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCO2O43819 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCO2O43819 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCO2O43819 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCO2O43819 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms