Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms