Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms