Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms