Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TARSL2A2RTX5 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TARSL2A2RTX5 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TARSL2A2RTX5 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TARSL2A2RTX5 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TARSL2A2RTX5 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TARSL2A2RTX5 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TARSL2A2RTX5 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TARSL2A2RTX5 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TARSL2A2RTX5 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TARSL2A2RTX5 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TARSL2A2RTX5 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TARSL2A2RTX5 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TARSL2A2RTX5 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TARSL2A2RTX5 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TARSL2A2RTX5 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TARSL2A2RTX5 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TARSL2A2RTX5 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TARSL2A2RTX5 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TARSL2A2RTX5 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TARSL2A2RTX5 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TARSL2A2RTX5 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TARSL2A2RTX5 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TARSL2A2RTX5 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TARSL2A2RTX5 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TARSL2A2RTX5 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TARSL2A2RTX5 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TARSL2A2RTX5 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TARSL2A2RTX5 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TARSL2A2RTX5 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms