Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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ARL2-SNX15V9GYD0 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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ARL2-SNX15V9GYD0 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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ARL2-SNX15V9GYD0 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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ARL2-SNX15V9GYD0 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
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ARL2-SNX15V9GYD0 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
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ARL2-SNX15V9GYD0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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ARL2-SNX15V9GYD0 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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