Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MAP3K4Q9Y6R4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MAP3K4Q9Y6R4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MAP3K4Q9Y6R4 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MAP3K4Q9Y6R4 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MAP3K4Q9Y6R4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MAP3K4Q9Y6R4 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MAP3K4Q9Y6R4 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MAP3K4Q9Y6R4 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms