Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y282

ERGIC3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC3Q9Y282 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERGIC3Q9Y282 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERGIC3Q9Y282 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERGIC3Q9Y282 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERGIC3Q9Y282 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERGIC3Q9Y282 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERGIC3Q9Y282 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ERGIC3Q9Y282 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ERGIC3Q9Y282 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERGIC3Q9Y282 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERGIC3Q9Y282 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERGIC3Q9Y282 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERGIC3Q9Y282 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERGIC3Q9Y282 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERGIC3Q9Y282 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ERGIC3Q9Y282 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ERGIC3Q9Y282 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ERGIC3Q9Y282 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ERGIC3Q9Y282 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ERGIC3Q9Y282 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ERGIC3Q9Y282 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERGIC3Q9Y282 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ERGIC3Q9Y282 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ERGIC3Q9Y282 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERGIC3Q9Y282 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERGIC3Q9Y282 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERGIC3Q9Y282 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERGIC3Q9Y282 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ERGIC3Q9Y282 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERGIC3Q9Y282 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ERGIC3Q9Y282 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ERGIC3Q9Y282 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERGIC3Q9Y282 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ERGIC3Q9Y282 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ERGIC3Q9Y282 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERGIC3Q9Y282 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERGIC3Q9Y282 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERGIC3Q9Y282 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ERGIC3Q9Y282 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ERGIC3Q9Y282 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERGIC3Q9Y282 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERGIC3Q9Y282 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ERGIC3Q9Y282 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERGIC3Q9Y282 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERGIC3Q9Y282 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ERGIC3Q9Y282 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERGIC3Q9Y282 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERGIC3Q9Y282 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERGIC3Q9Y282 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERGIC3Q9Y282 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERGIC3Q9Y282 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERGIC3Q9Y282 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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