Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms