Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ8

DOLK, Dolichol kinase, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DOLKQ9UPQ8 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DOLKQ9UPQ8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DOLKQ9UPQ8 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DOLKQ9UPQ8 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DOLKQ9UPQ8 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DOLKQ9UPQ8 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DOLKQ9UPQ8 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms