Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms