Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms