Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms