Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms