Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms