Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms