Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms