Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM30AQ9NV96 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM30AQ9NV96 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM30AQ9NV96 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM30AQ9NV96 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM30AQ9NV96 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM30AQ9NV96 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM30AQ9NV96 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM30AQ9NV96 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM30AQ9NV96 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM30AQ9NV96 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM30AQ9NV96 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM30AQ9NV96 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM30AQ9NV96 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM30AQ9NV96 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM30AQ9NV96 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM30AQ9NV96 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM30AQ9NV96 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM30AQ9NV96 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM30AQ9NV96 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM30AQ9NV96 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM30AQ9NV96 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM30AQ9NV96 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM30AQ9NV96 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM30AQ9NV96 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM30AQ9NV96 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM30AQ9NV96 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM30AQ9NV96 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM30AQ9NV96 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM30AQ9NV96 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM30AQ9NV96 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM30AQ9NV96 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM30AQ9NV96 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM30AQ9NV96 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM30AQ9NV96 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM30AQ9NV96 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM30AQ9NV96 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM30AQ9NV96 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM30AQ9NV96 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM30AQ9NV96 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM30AQ9NV96 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM30AQ9NV96 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM30AQ9NV96 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms