Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms