Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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PFDN4Q9NQP4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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PFDN4Q9NQP4 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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