Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01830-201ENST00000450551 636 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 C3orf52-204ENST00000480282 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093835.1-201ENST00000508072 568 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SDHD-205ENST00000528048 905 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL488P-201ENST00000585186 286 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC136475.1-203ENST00000602756 1034 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXW7-212ENST00000604872 970 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms