Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACTRT3Q9BYD9 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms