Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms