Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HINFPQ9BQA5 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HINFPQ9BQA5 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HINFPQ9BQA5 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms