Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms