Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms