Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms