Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms