Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms