Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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