Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 LRRC15-201ENST00000347624 5883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 HEXA-201ENST00000268097 5252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.4 ms