Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms