Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms