Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3CQ92520 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms