Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNBP2Q8WZ74 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNBP2Q8WZ74 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNBP2Q8WZ74 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNBP2Q8WZ74 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNBP2Q8WZ74 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNBP2Q8WZ74 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNBP2Q8WZ74 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNBP2Q8WZ74 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNBP2Q8WZ74 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNBP2Q8WZ74 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNBP2Q8WZ74 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNBP2Q8WZ74 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNBP2Q8WZ74 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNBP2Q8WZ74 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNBP2Q8WZ74 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNBP2Q8WZ74 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNBP2Q8WZ74 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNBP2Q8WZ74 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNBP2Q8WZ74 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNBP2Q8WZ74 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNBP2Q8WZ74 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNBP2Q8WZ74 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNBP2Q8WZ74 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNBP2Q8WZ74 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNBP2Q8WZ74 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNBP2Q8WZ74 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNBP2Q8WZ74 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CTTNBP2Q8WZ74 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CTTNBP2Q8WZ74 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTTNBP2Q8WZ74 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CTTNBP2Q8WZ74 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTTNBP2Q8WZ74 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTTNBP2Q8WZ74 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CTTNBP2Q8WZ74 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTTNBP2Q8WZ74 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CTTNBP2Q8WZ74 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CTTNBP2Q8WZ74 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTTNBP2Q8WZ74 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTTNBP2Q8WZ74 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTTNBP2Q8WZ74 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTTNBP2Q8WZ74 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CTTNBP2Q8WZ74 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CTTNBP2Q8WZ74 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CTTNBP2Q8WZ74 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CTTNBP2Q8WZ74 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CTTNBP2Q8WZ74 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms