Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVB6

CHTF18, Chromosome transmission fidelity protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18Q8WVB6 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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CHTF18Q8WVB6 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTF18Q8WVB6 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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