Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms