Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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CLIP4Q8N3C7 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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CLIP4Q8N3C7 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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CLIP4Q8N3C7 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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CLIP4Q8N3C7 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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CLIP4Q8N3C7 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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CLIP4Q8N3C7 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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CLIP4Q8N3C7 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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CLIP4Q8N3C7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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CLIP4Q8N3C7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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