Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWL1

SFTPA2, Pulmonary surfactant-associated protein A2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPA2Q8IWL1 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPA2Q8IWL1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms