Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms