Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms