Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms