Protein–RNA interactions for Protein: Q5TG30

ARHGAP40, Rho GTPase-activating protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP40Q5TG30 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms