Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms