Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms