Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR44Q5JSH3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR44Q5JSH3 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR44Q5JSH3 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR44Q5JSH3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR44Q5JSH3 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR44Q5JSH3 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR44Q5JSH3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR44Q5JSH3 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR44Q5JSH3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR44Q5JSH3 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR44Q5JSH3 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR44Q5JSH3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR44Q5JSH3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR44Q5JSH3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR44Q5JSH3 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR44Q5JSH3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR44Q5JSH3 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR44Q5JSH3 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR44Q5JSH3 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR44Q5JSH3 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR44Q5JSH3 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR44Q5JSH3 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR44Q5JSH3 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR44Q5JSH3 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR44Q5JSH3 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR44Q5JSH3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR44Q5JSH3 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR44Q5JSH3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR44Q5JSH3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR44Q5JSH3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR44Q5JSH3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR44Q5JSH3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR44Q5JSH3 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR44Q5JSH3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR44Q5JSH3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR44Q5JSH3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR44Q5JSH3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR44Q5JSH3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR44Q5JSH3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms