Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms