Protein–RNA interactions for Protein: Q56A73

SPIN4, Spindlin-4, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN4Q56A73 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms