Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms